产品概述
产品优势
应用场景
使用限制
常见问题
如何登录腾讯健康组学平台？
本平台由 控制台 > 腾讯健康组学平台模块 和 腾讯健康组学平台网站 两个部分组成。管理员可使用腾讯云账号登录腾讯云控制台，进入 控制台 > 腾讯健康组学平台模块 创建环境和多个用户账号，相关操作可参见 环境管理 和 用户管理。管理员完成环境创建和用户创建相关流程后，平台的使用者可前往 腾讯健康组学平台网站，通过管理员创建的用户账号登录，使用平台开启分析任务。
数据文件存储在哪里？
本平台的数据存储依赖于 腾讯云对象存储 COS 向用户提供文件管理服务，数据存储在 COS 存储桶中，数据文件的上传下载操作需在腾讯云对象存储 COS 中完成。平台的文件管理页面，则主要提供查看文件目录功能。
如何上传文件？
上传文件至腾讯云对象存储 COS 有三种方式，分别是控制台上传、命令行上传和数据迁移。
控制台上传：请参见 对象存储相关文档：上传对象。
命令行上传：请参见 对象存储相关文档：上传下载或拷贝文件。
数据迁移：请参见 对象存储相关文档：本地数据迁移至 COS。
如何下载文件？
控制台下载：请参见 对象存储相关文档：下载对象。
命令行下载：请参见 对象存储相关文档：COSCLI 简介-上传下载或拷贝文件。
除 WDL 外，是否支持其他工作流语言标准？
腾讯健康组学平台目前仅支持 WDL 语言编辑生信应用，我们计划在下一阶段支持更多工作流语言（Nextflow、Snakemake等），相关功能模块正在开发中。更多工作流语言需求，欢迎联系反馈。
如何查看作业执行环境及资源使用状况？
1. 如需查看某一作业的执行环境及资源使用状况，可在任务详情页单击待查看作业对应详情。
2. 作业详情页将显示该作业的执行环境（如 CPU 核数、内存规格、Docker 镜像地址等）和资源监控图表（如 CPU 利用率、内存利用率等）。
如何上传包含多个 fastq 文件的样本进行分析？
1. 创建表格模板，样本表格可参考以下格式设置，每个 sample_id 对应多个 fastq 文件地址，以 Array[File] 形式呈现。创建表格相关操作可参见 表格管理。
2. 上传表格。
3. 在 WDL 文件中将输入文件数据类型定义为 Array[File]，并在运行设置页选取相关目录，运行设置相关操作可参见 应用管理。
4. 开始分析。
组学计算环境如何使用企业版容器镜像服务？
组学计算环境如需使用企业版容器镜像服务，需要确保已选择对应的镜像访问凭证和组学计算环境到镜像服务网络打通。
确保已选择对应的企业版镜像访问凭证
确保组学计算环境到企业版镜像服务网络打通
组学计算环境与企业版容器镜像服务之间的网络默认不通，因此在拉取企业版镜像仓库中的镜像时会报网络不通的错误。
解决步骤
处理方式有以下两种，具体操作可参考下表中各方式对应的文档指引：
处理方式 | 说明 | 文档指引 |
方式1：内网访问方式 | 容器镜像服务新建内网访问链路，并配置内网域名解析，组学计算环境内嵌的 Serverless 集群通过新建的内网链路访问容器镜像服务。 | |
方式2：外网访问方式 | 组学计算环境内嵌的 Serverless 集群开启外网访问，通过公网访问容器镜像，同时容器镜像服务也需允许公网访问。 | |
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